Zotero与坚果云的集成主要涉及两种不同类型的同步：数据同步和文件同步。当您提到“Zotero坚果云只有数据同步”时，这可能意味着您当前的设置仅涉及同步Zotero数据库中的元数据，而不包括附件或源文件的同步。
数据同步
原理：数据同步主要是将您的文献记录、标签、笔记等基本信息同步到Zotero的在线数据库中。这意味着，通过网页版Zotero或其他设备登录同一账户，您可以访问这些信息。
作用：确保您的收藏列表、笔记和元数据在不同设备间保持一致，但不包括存储在本地的PDF或其他附件文件。
文件同步（通常通过WebDAV实现，包括坚果云）
原理：如果要同步附件，通常需要利用WebDAV协议，而坚果云支持WebDAV，因此可以作为Zotero附件的存储和同步服务。用户需要在Zotero的偏好设置中配置坚果云的WebDAV信息，以实现附件的云端存储和同步。
操作步骤：
关闭Zotero内置的数据同步中的文件同步选项。
在“编辑”>“首选项”>“同步”中设置坚果云的WebDAV地址、用户名和密码。
设置Zotfile插件（可选），以自动管理附件的重命名和移动到指定的坚果云同步文件夹。
使用Zotfile的进阶操作
Zotfile功能：Zotfile插件可以进一步优化附件管理，通过自动重命名下载的文件，并将其移动到您定义的本地文件夹（通常是与坚果云同步的文件夹），之后这些链接附件会被Zotero跟踪。
设置：确保Zotfile的设置与Zotero的文件存储位置协调一致，这样附件可以正确地保存和同步到坚果云。
注意事项
坚果云同步规则：坚果云有其特定的同步逻辑，确保您的本地存储和坚果云之间文件的一致性。
避免乱码：直接通过Zotero的WebDAV同步到坚果云可能会遇到文件乱码问题，使用坚果云作为中间层可以规避这一问题。
如果您希望实现附件的同步，确保您已经正确配置了文件同步部分，利用Zotero的WebDAV设置与坚果云集成，或者通过Zotfile的高级管理来优化这一流程。这样，您的文献数据库不仅包含元数据，还能包含所有相关的附件，实现全面的同步。