如果你在使用Zotero时发现编辑菜单中没有首选项选项，或者在寻找与PDF相关的设置但未能找到，这可能是由于界面导航的误解或软件配置问题。请按照以下步骤尝试解决：
1. 界面导航确认：
对于Windows和Linux用户，通常Zotero的首选项应该直接在顶部菜单栏的“编辑”下找到，点击“编辑”>“首选项”来访问设置。
如果你是Mac用户，首选项可能不在Zotero应用内部的菜单中直接显示。你需要点击屏幕左上角的苹果菜单（?），然后在Zotero的下拉菜单中找到“偏好设置”（Preferences），这是Mac应用常见的界面布局差异。
2. PDF相关设置：
PDF处理和存储位置的设置通常在Zotero的首选项对话框中。一旦你找到了“首选项”或“偏好设置”，选择“高级”或“文件和文件夹”标签，这里可以设置数据存储位置，包括PDF文件的存放路径。
对于PDF的注释同步或处理，你可能需要查看“ZotFile”插件的设置。ZotFile是一个流行的插件，用于管理Zotero中的PDF文件，安装后它会在“工具”菜单下添加一个入口。确保你已经安装了ZotFile，并正确配置了它的设置。
3. 插件问题：
如果是特定功能如PDFtk Server路径设置缺失，确保你已经安装了必要的插件，比如处理PDF的工具，并且它们已经正确配置。在“编辑”>“首选项”中，可能会有额外的插件设置选项，尤其是在“茉莉花”或中文插件设置中，尽管这个命名听起来不像是官方部分，可能是特定于第三方插件的设置。
4. 软件更新：
确保你的Zotero软件是最新版本。有时，旧版本可能缺少某些功能或界面元素。可以通过Zotero的“帮助”菜单检查更新。
5. 重置或重新安装：
如果上述方法都无法解决问题，考虑备份你的Zotero数据（包括数据库和附件），然后重置或重新安装Zotero。这有时能解决配置错误或缺失菜单的问题。
如果问题依然存在，可能需要查看Zotero的官方文档或社区论坛，那里通常会有针对特定问题的解决方案或用户经验分享。