Zotero 是一个强大的文献管理工具，它本身就能够支持添加注释和笔记。您可以在阅读文献时直接在 Zotero 中进行标注和笔记记录。具体步骤如下：
1. 建立文件库与分类：开始时，您需要在 Zotero 的左侧栏创建文件库，并可以根据研究领域或项目对文献进行分类。
2. 抓取文献：Zotero 可以通过浏览器插件直接从网页抓取文献信息，包括标题、作者、出版年份等，自动添加到您的文件库中。
3. 做笔记与标签：
在文献列表中打开一篇文献，您可以选中文献中的文本进行高亮，并通过上方的工具栏给高亮部分添加颜色编码的标签。
您可以为每个颜色设定特定的意义，比如红色表示引用内容，黄色代表相关主题，绿色用于写作词汇等。
直接在文献视图中添加注释，Zotero 会自动生成笔记，并在左侧列出对应的标签。
右击文献，选择“从注释添加笔记”或直接在文献列表中添加笔记，便于整合您的思考和理解。
4. 标签与分类：Zotero 自动根据下载的文献生成标签，您也可以手动添加标签，帮助快速检索文献。完成阅读和笔记后，可以使用蓝色标签标记文献已处理。
5. 关联文献：Zotero 允许您为文献建立关联，通过“关联文献”功能，可以在文献之间建立联系，便于追踪相关研究。
如果您希望进一步增强笔记功能，可以考虑使用插件如 `zoterobetternotes`。这个插件提供了更丰富的笔记组织方式，包括大纲视图、思维导图和气泡视图，使得笔记结构化，便于构建知识体系。它允许您在文献之外创建更详细的笔记结构，并且支持多种格式导出，方便在其他平台如 Obsidian、OneNote 或 Word 中使用。
Zotero 不仅能帮助您管理参考文献，还能通过其内置的笔记功能和第三方插件的强大支持，使文献阅读和注释过程更加高效和系统化。