在科研和学习中，Zotero 结合其他笔记软件可以形成强大的知识管理工具链。以下是一些推荐的搭配方式，特别适合用于通过Zotero进行笔记整理：
1. Zotero + Obsidian
联动方式：通过插件如“Zotero Integration”或“Zotero Better Notes”，可以将Zotero中的文献信息、标注和笔记无缝导入Obsidian。Obsidian以其强大的链接系统著称，适合构建知识图谱。
优势：Obsidian的Markdown支持和图谱视图有助于知识的非线性组织，而Zotero专注于文献管理，两者结合能有效提升文献阅读和笔记整理的效率。
特色功能：使用Obsidian的Markmind插件可以模拟Marginnote的功能，实现思维导图式的笔记整理。
2. Zotero + Zotero Better Notes插件
直接增强：如果你偏好在Zotero内部完成笔记，Zotero Better Notes插件提供了大纲视图、思维导图和气泡视图，使得在Zotero内部就能创建结构化的笔记，支持Markdown，增强笔记的可读性和组织性。
功能亮点：该插件允许用户在文献条目下直接建立笔记结构，通过不同的视图模式来管理和查看笔记内容，同时支持导出为多种格式，便于分享和长期保存。
3. Zotero + OneNote/Word
辅助工具：对于包含大量图片、表格的笔记，可以在Zotero笔记中留下链接，实际内容存储在OneDrive或Word文档中，这样既利用了Zotero的文献管理能力，又发挥了专业文档编辑软件的优势。
4. Zotero + Logseq
双向链接笔记：Logseq也是一个双链笔记工具，适合构建知识库。虽然提及较少，但其开源和对知识管理的深度支持，使其成为Zotero用户的另一个选择，尤其是偏好基于块的笔记方式的用户。
这些组合利用了Zotero在文献管理上的强大功能，结合其他笔记软件或插件在笔记整理、知识链接方面的优势，形成了灵活多样的个人知识管理系统。选择哪种方式取决于个人的工作习惯、对软件功能的需求以及是否需要跨平台操作等因素。